Kostra:

- skelet převážně kostěný, sekundárně může dojít k převaze chrupavky (chondrostei), ale kost nikdy zcela nezmizí
- rozvoj dermálního skeletu (osifikace na podkladě vaziva ve škáře)
- platybazická lebka – lalokoploutví, dvojdyšní, násadcoploutví
- tropibazická lebka – většina paprskoploutvých
- osní kostru ryb tvoří páteř z obratlů, které nejsou diferencovány, ale mohou být v různých částech páteře různě velké, jejich počet může kolísat
- většina ryb má obratle s úplnými těly (holospondylní) tvaru amficélního, které mají na dorzální straně horní oblouky, tvořící míšní kanál
- u Dipnoi chorda zachovalá, nezaškrcovaná, protože obratle tvoří pouze chrupavčité nebo osifikované oblouky (aspondylní obratle); u Actinopteygii je chorda potlačována a zaškrcována těly obratlů
- poměrně jednoduše je stavěna lebka starobylých skupin; u paprskoploutvých (u nich zejména u kostnatých) je lebka velmi komplikovaná rozvojem dermálních kostí
- značné rozdíly ve stavbě kostry končetin – u starobylých skupin kosti náhradní, u pokročilých kosti krycí
- největší rozvoj nastal v lopatkovém pásmu paprskoploutvých